生物質鍋爐除塵器的過濾原理是在系統主風機作用下，含塵氣體從淀粉廠專用除塵器的進風口進入，經過氣流均化裝置，轉而向下進入灰斗。帶塵氣體通過灰斗后進入除塵器布袋過濾區，氣體穿過濾袋，粉塵被留在濾袋外表面。凈化后的氣體經濾袋口進入凈氣室，再由出風口排出。
生物質鍋爐除塵器的工作原理：
1：由于流速減緩，加上慣性及粉塵的自重作用，使氣體中大顆粒粉塵受慣性力作用被分離出來，直接落入灰斗。
2：隨著過濾時間的延長，濾袋上的粉塵層不斷積厚，阻力不斷上升，當阻力上升到設定值時，清灰裝置開始進行清灰。
生物質鍋爐除塵器在處理高溫、高濕度氣體時，如操作中的氣體溫度低于露點，則水蒸氣會冷卻凝結，使濾清器袋受潮，而且大量的灰塵會粘在濾袋的表面，堵塞濾袋的毛孔，而吹出的壓縮空氣無法去除，造成濾袋糊狀袋。如果濾袋上附著的灰塵在清洗脈沖袋灰塵時無法有效去除，則灰塵逐漸堆積在濾袋的外表面，漿袋被堵塞。